Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms