Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms