Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snw1Q9CSN1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms