Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms