Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms