Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbQ9CR53 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbQ9CR53 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms