Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ska2Q9CR46 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms