Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb9Q9CQJ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms