Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpb2Q9CQI7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms