Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms