Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic3Q9CQE7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms