Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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