Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NepnQ9CQ76 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NepnQ9CQ76 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms