Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnaseh2cQ9CQ18 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnaseh2cQ9CQ18 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnaseh2cQ9CQ18 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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