Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms