Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl17Q9CPR4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl17Q9CPR4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms