Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt23Q99PS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt23Q99PS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms