Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lpin3Q99PI4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lpin3Q99PI4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms