Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim3Q99PE5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms