Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GpnmbQ99P91 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms