Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird2Q99NI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird2Q99NI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms