Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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