Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll1Q99NC0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms