Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac9Q99N13 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms