Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms