Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rwdd2bQ99M03 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rwdd2bQ99M03 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms