Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms