Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms