Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rcbtb2Q99LJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms