Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH2

Ptdss1, Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1Q99LH2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptdss1Q99LH2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptdss1Q99LH2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms