Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms