Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pagr1aQ99L02 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pagr1aQ99L02 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms