Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DhddsQ99KU1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DhddsQ99KU1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms