Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms