Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dok4Q99KE3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dok4Q99KE3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms