Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms