Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ddb2Q99J79 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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