Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms