Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms