Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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