Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms