Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms