Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atpaf2Q91YY4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms