Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lims2Q91XD2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms