Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klc3Q91W40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klc3Q91W40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms