Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms