Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms