Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf4Q8VE97 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf4Q8VE97 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms