Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uba5Q8VE47 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Uba5Q8VE47 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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