Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgip1Q8VD37 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms